Studi di IAIN Ponorogo hanya dikenakan biaya UKT (Uang Kuliah Tunggal) yang besarannya per semester selalu tetap. Mahasiswa tidak dibebani dengan biaya gedung, biaya ujian, biaya skripsi, biaya KPM (KKN), bahkan biaya wisuda karena seluruh biaya tersebut telah ditanggung oleh negara. Besaran UKT ditetapkan oleh Menteri Agama melalui KMA No.1195 Tahun 2019
Berikut adalah besaran UKT pada masing-masing program studi di Lingkungan IAIN Ponorogo, mulai semester gasal tahun akademik 2021
| No | Fakultas | Jurusan | 2021 | |||||
| I | II | III | IV | V | KIPK | |||
| 1 | Fakultas Syariah | Ahwal Syakhsiyah | 400.000 | 1.300.000 | 1.400.000 | 1.550.000 | 1.800.000 | 2.400.000 |
| Muamalah | 400.000 | 1.250.000 | 1.350.000 | 1.500.000 | 1.700.000 | 2.400.000 | ||
| Hukum Tata Negara | 400.000 | 1.200.000 | 1.300.000 | 1.450.000 | 1.650.000 | 2.400.000 | ||
| 2 | Fakultas Tarbiyah dan Ilmu Keguruan |
Pendidikan Agama Islam |
400.000 | 1.400.000 | 1.600.000 | 1.800.000 | 2.100.000 | 2.400.000 |
| Pendidikan Bahasa Arab |
400.000 | 1.250.000 | 1.350.000 | 1.500.000 | 1.750.000 | 2.400.000 | ||
| Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah | 400.000 | 1.300.000 | 1.400.000 | 1.550.000 | 1.800.000 | 2.400.000 | ||
| Tadris Bahasa Inggris | 400.000 | 1.300.000 | 1.400.000 | 1.550.000 | 1.800.000 | 2.400.000 | ||
| Pendidikan Islam Anak Usia Dini | 400.000 | 1.300.000 | 1.400.000 | 1.550.000 | 1.800.000 | 2.400.000 | ||
| Manajemen Pendidikan Islam | 400.000 | 1.300.000 | 1.400.000 | 1.550.000 | 1.800.000 | 2.400.000 | ||
| Tadris IPA | 400.000 | 1.250.000 | 1.350.000 | 1.500.000 | 1.700.000 | 2.400.000 | ||
| Tadris IPS | 400.000 | 1.250.000 | 1.350.000 | 1.500.000 | 1.700.000 | 2.400.000 | ||
| 3 | Fakultas Ushuluddin, Adab, dan Dakwah |
Ilmu Al-Quran & Tafsir | 400.000 | 1.200.000 | 1.300.000 | 1.450.000 | 1.650.000 | 2.400.000 |
| Komunikasi Penyiaran Islam | 400.000 | 1.250.000 | 1.350.000 | 1.500.000 | 1.750.000 | 2.400.000 | ||
| Bimbingan Penyuluhan Islam | 400.000 | 1.200.000 | 1.300.000 | 1.450.000 | 1.650.000 | 2.400.000 | ||
| 4 | Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam |
Ekonomi Syariah | 400.000 | 1.400.000 | 1.600.000 | 1.800.000 | 2.100.000 | 2.400.000 |
| Perbankan Syariah | 400.000 | 1.400.000 | 1.600.000 | 1.800.000 | 2.100.000 | 2.400.000 | ||
| Manajemen Zakat & Wakaf | 400.000 | 1.000.000 | 1.100.000 | 1.200.000 | 1.400.000 | 2.400.000 | ||
| Besaran UKT | IAIN Ponorogo | |||||||